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この記事の内容は修正されています。
参考記事は
GeeklohJapan掲示板記事-２階層メニューのCSSの位置換えについて。

２階層メニュープラグインは問題なく使えてるのですが
W3CのHTMLチェックをすると使用するカラムの一番最初に
CSSリンクが読み込まれてるので
「ここでこれを使ったらだめ」エラーが表示されてしまいます。
そこで

nomoxmenuのfunctions.incの３３６行目辺りの
$retval="<link rel='stylesheet' type='text/css'～の行をコメントアウトして
使うテーマのCSSフォルダ→pluginフォルダにstyle.cssと
imagesフォルダをコピーしplugin.cssで読み込ます。すると表示されていたCSSリンクが無くなるのでこの部分のW3CはOKです。

最後に素晴らしいプラグインを作成されているnomoxさんに
心よりの感謝をこめて、ありがとうございます。